- PCR anidada: La PCR anidada conocida como Nested PCR es una variante de la PCR convencional que comprende dos rondas de amplificación con distintos pares de cebadores en cada una, con el fin de incrementar la sensibilidad y la especificidad de la detección. Primero se realiza una reacción con los cebadores externos para amplificar una región de ADN mas extensa, que contiene el segmento diana. Después, este producto de amplificación se utiliza como molde de una segunda PCR con los cebadores internos para amplificar la región específica.
- PCR múltiple: Se lleva a cabo la reacción de PCR tradicional, pero con mas de 2 primers, para amplificar varias regiones al mismo tiempo.
- PCR in situ: Es una PCR que se realiza en preparaciones fijadas sobre un portaobjeto. Consiste en una reacción de PCR en secciones histológicas o células, donde los productos generados pueden visualizarse en el sitio de amplificación. Se realiza para ello una primera amplificación del ADN blanco y luego detección mediante hibridación in situ convencional con sondas de ADN/ARN. De esta manera puede detectarse cantidades pequeñísimas del material genético.
- PCR con transcriptasa inversa (RT-PCR): Este tipo de PCR utiliza como molde inicial el ARN y se requiere de una transcriptasa inversa, para realizar la conversión del ARN a un tipo de ADN llamado ADNc.

1.er paso: retro transcripción a partir del ARN.
2 do paso: amplificación a partir de la primera hebra de ADNc.
3.er paso: PCR estándar
- PCR en tiempo real: Es
una variante de la reacción en cadena de la polimerasa utilizada para amplificar
y simultáneamente cuantificar de forma absoluta el producto de la amplificación
de ácido desoxirribonucleico PCR en tiempo real.
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